Naujo šizofrenijos tyrimo metu pagrindinis dėmesys skiriamas baltymų ir baltymų sąveikai

Panašiai kaip ir žmonėms, apie geną galima daug sužinoti, pažvelgus į savo laikomą įmonę ir stebint, kaip jis elgiasi. Siekdami sužinoti daugiau užuominų apie šizofrenijos išsivystymą, Pitsburgo universiteto medicinos mokyklos mokslininkai ištyrė, kaip sąveikauja baltymai, kuriuos gamina su šizofrenija susiję genai.

"Mes galime padaryti išvadą, ką gali sukelti baltymai, patikrindami savo laikomą įmonę", - sakė vyresnysis tyrėjas Madhavi Ganapathiraju, Ph.D., biomedicinos informatikos docentas, Pitto medicinos mokykla.

„Pavyzdžiui, jei žinau, kad turite daug draugų, žaidžiančių ledo ritulį, tai gali reikšti, kad ir jūs užsiimate ledo rituliu. Panašiai, jei matome, kad nežinomas baltymas sąveikauja, pavyzdžiui, su daugeliu baltymų, susijusių su nervų signalizavimu, yra didelė tikimybė, kad nežinomas subjektas taip pat dalyvauja tame pačiame procese “.

Naujausios istorijos metu mokslininkai atliko daugelį genomo asociacijos tyrimų (GWAS), kurie sėkmingai nustatė genų variantus, susijusius su padidėjusia šizofrenijos rizika. Tačiau apie baltymus, kuriuos gamina šie genai, ką jie veikia ir kaip jie sąveikauja, žinoma palyginti nedaug.

"GWAS tyrimai ir kitos mokslinių tyrimų pastangos parodė, kokie genai gali būti reikšmingi sergant šizofrenija", - sakė Ganapathiraju. „Tai, ką mes padarėme, yra kitas žingsnis. Mes stengiamės suprasti, kaip šie genai yra susiję vienas su kitu, o tai galėtų parodyti biologinius kelius, kurie yra svarbūs sergant liga “.

Trumpai tariant, kiekvienas genas gamina baltymus, ir šie baltymai paprastai sąveikauja tarpusavyje biologiniame procese. Tyrimas, kaip šie baltymai elgiasi tarpusavyje, gali atskleisti geno, kuris dar netirtas, vaidmenį, atskleisti su šizofrenija susijusius kelius ir biologinius procesus, taip pat jo ryšį su kitomis sudėtingomis ligomis.

Sukūrę ir panaudoję naują skaičiavimo modelį, vadinamą didelio tikslumo baltymų sąveikos prognozavimu (HiPPIP), mokslininkai atrado daugiau nei 500 naujų baltymų ir baltymų sąveikos (PPI), susijusių su genais, susijusiais su šizofrenija.

Tyrėjai priduria, kad nors istoriškai nustatyti ir su šizofrenija susiję genai ir per GWAS mažai sutapo, modelis parodė, kad jie turi daugiau nei 100 bendrų sąveikų. Išvados gali padėti geriau suprasti šios psichinės ligos biologinius pagrindus, taip pat nurodyti gydymo būdą.

Rezultatai paskelbti internete npj šizofrenija, „Nature Publishing Group“ žurnalas.

Šaltinis: Pitsburgo universiteto sveikatos mokslų mokyklos